Tổng hợp điểm mới Thông tư 99/2016/TT-BTC về quản lý hoàn thuế GTGT

STT

Điểm mới

Quy định trước đây

01

02

– Dẫn chiếu các quy định riêng về trường hợp được hoàn thuế, điều kiện hoàn thuế, việc tiếp nhận và giải quyết hoàn thuế đối với thuế GTGT đã được quy định tại Luật.

– Làm rõ nguyên tắc áp dụng quản lý rủi ro trong quản lý hoàn thuế GTGT.

03

– Kinh phí hoàn thuế GTGT  dự toán tại ngân sách nhà nước và Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế quản lý, điều hành chi hoàn thuế GTGT trong phạm vi dự toán ngân sách được giao.

– Cục trưởng Cục Thuế quản lý, sử dụng kinh phí hoàn thuế GTGT để chi hoàn cho NNT theo thẩm quyền.

04

05

– Khoản 1 Điều 1 Luật quản lý thuế sửa đổi 2012

– Khoản 2 Điều 1 Luật số 106/2016/QH13

– Thông tư số 204/2015/TT-BTC

06

– Quy định rõ việc cơ quan thuế tra cứu, căn cứ thông tin trên Tờ khai hải quan để giải quyết hoàn thuế GTGT.

– Bổ sung hướng dẫn về trách nhiệm của Tổng cục Hải quan trong việc thêm tiêu chí, chỉ số phân loại rủi ro.

07

Bổ sung hướng dẫn cụ thể đổi với phát hiện, xử lý hành vi gian lận thuế, trốn thuế

08

– Đối với 4 tỉnh, thành phố (Hà Nội, Hồ Chí Minh, Bình Dương, Đồng Nai): Cục Thuế thực hiện toàn bộ quy trình hoàn thuế hoặc Chi cục Thuế thực hiện các công tác sơ bộ trước khi chuyển cho Cục thuế thẩm định và ban hành quyết định hoàn thuế.

– Đối với 59 tỉnh, thành phố còn lại: Cục Thuế có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế cho NNT bao gồm cả NNT do Chi cục Thuế quản lý trực tiếp.

09

– Bổ sung thêm: đơn vị phụ thuộc của NNT là  đối tượng phải có văn bản ủy quyền của doanh nghiệp trụ sở chính

– Bổ sung quy định: NNT đã gửi hồ sơ đề nghị hoàn thuế nhưng sau đó có văn bản hủy đề nghị hoàn thuế thì NNT được khai điều chỉnh, bổ sung số thuế đề nghị hoàn chuyển khấu trừ tiếp vào tờ khai thuế GTGT của kỳ kê khai tiếp theo nếu đáp ứng đủ điều kiện khấu trừ thuế GTGT.

–  Chưa có quy định đối với trường hợp hủy đề nghị hoàn thuế

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

– Sửa đổi quy định về việc Tổng cục Thuế thực hiện báo cáo Bộ Tài chính trong trường hợp phát sinh số thuế GTGT phải hoàn vượt nguồn kinh phí đã được bố trí trong dự toán được duyệt.

(Điều 22)

24

25

26

27

28

– Xây dựng cơ sở dữ liệu và ứng dụng công nghệ thông tin để thực hiện hoàn thuế điện tử, áp dụng quản lý rủi ro trong hoàn thuế GTGT..

– Lập dự toán kinh phí hoàn thuế GTGT, quản lý dự toán và chi hoàn thuế GTGT trong phạm vi dự toán hoàn thuế GTGT đã được phê duyệt, thực hiện quyết toán chi hoàn thuế GTGT, thu hồi hoàn thuế GTGT đảm bảo an toàn, chặt chẽ tiền của ngân sách nhà nước và theo đúng quy định của pháp luật.

29

30